En 1906, Joseph-Elzéar se vit confier la première mission d’une série de trois expéditions officielles qui avaient pour objectif d’établir la souveraineté du Canada dans les îles de l’archipel arctique. L’une de ses principales tâches consistait à délivrer des permis de pêche aux baleiniers et aux pêcheurs. La mise en place de lois canadiennes dans les territoires polaires était un moyen, entre autres, de prouver la souveraineté du pays dans l’archipel arctique.